안녕하세요. IT컨설턴트입니다. ^^
쇼핑몰 제작 순서는 일반적으로  
아이템의 선정
사업자등록
도메인등록
홈페이지 구축
통신판매신고 및 계좌 개설
카드결제신청
이런 단계를 갖고 있습니다.
홈페이지를 구축하기전에 아이템 선정, 사업자 등록증, 도메인 등록을 완료해놓으셔야 겠죠.
물론 업체를 통해서 안내를 받으셔도 좋구요.

또한 쇼핑몰 제작 비용은요..
견적을 내 보시면,말씀해주신 것처럼 아마도 가격의 차이가 많이 날것입니다. 쇼핑몰 제작은 겉으로 보기에는 비슷해 보일수 있습니다. 하지만 예전과는 다르게 Web사이트를 보는 User의 눈높이도 상당히 높아졌습니다. 사이트를 접속했을때의 첫인상, UI, 레이아웃, 컬러, 이런 비주얼적인 요소 뿐만 아니라, 관리상의 효율성, 서버 및 네트워크의 안정성, UEX의 반영, 신기술의 적용 등에 따라서 수많은 경우의 수가 나옵니다.
그런 부분을 생각하신 후, 홈페이지 제작 방법을 선택하셔야 겠죠.

현재 저렴한 범용적인 쇼핑몰 솔루션들이 많이 시중에 나와있습니다.
문제는 범용적이라는데 있습니다...
많은 사람들이 쇼핑몰을 만들때 기존에 개발된 쇼핑몰 솔루션을 가지고 저렴한 방법으로 구축을 하고 있습니다.
하지만, 범용적으로 구축된 쇼핑몰은.. 여러가지 단점이 있을수 밖에 없습니다.
경쟁업체가 동일한 솔루션으로 더 최신 디자인으로 무장을 하고 시장진입을 해왔다면, 어떻게 대처를 하실까요?아마도 마케팅 경쟁을 통해서 해결해 나가셔야 할듯 합니다.
관리자 페이지에서 쓰는 기능보다 쓰지 않는 기능이 더 많아서,  학습을 해야되는 경우가 발생할 수도 있습니다.
관리자 페이지는 손쉽게 쇼핑몰을 관리하기 위해서 만든 페이지입니다..
이를 학습까지 해야할 정도라면.. 원래의 목적과는 거리가 있겠죠...
물론.. 가격대비 효율적인 측면에서는 기존 솔루션이 긍정적입니다.
하지만, 특화된 아이템을 표현하기에는 과연 적합할까요?.... 해당 아이템에만 사용하는 기능이 있다면 어떨까요?... 신중히 고려해 보셔야 하는 상황입니다.
그렇기 때문에 쇼핑몰에 도입한 여러요소를 검토해보신 뒤, 구축업체를 찾아보시는것이 현명한 선택이라고 보여지네요. ^^